More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2596 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2596  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0656531  normal  0.651442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2884  translation initiation factor IF-1  91.67 
 
 		 72 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1845  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  70.42 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  73.24 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4936  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000594516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1113  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508115  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2622  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.378683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0588  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1003  translation initiation factor IF-1  65.22 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4295  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 74 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0959  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1927  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29500  translation initiation factor 1  66.2 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2630  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  99.4  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  66.2 
 
 		 73 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0650  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0609  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  98.6  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  65.28 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3117  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  63.24 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 74 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  61.76 
 
 		 72 aa  99.4  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2998  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1138  translation initiation factor IF-1  67.61 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000117845  normal  0.0449626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1552  translation initiation factor IF-1  62.32 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  64.79 
 
 		 72 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1790  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  97.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23570  translation initiation factor 1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2659  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  63.24 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0711  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0300  translation initiation factor IF-1  66.2 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000294229  hitchhiker  0.0000161331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04210  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.554709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2944  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1137  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0248  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 75 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2929  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204255 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1108  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  63.24 
 
 		 75 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1125  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.609417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1431  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 73 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  60.56 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  96.7  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  95.9  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  61.97 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0788  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0427715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  64.79 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  63.38 
 
 		 72 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>