122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2014 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2014  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  270  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  50.88 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  40.17 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  34.58 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  34.58 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  45.57 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  34.23 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  32.28 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  41.1 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  40.23 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0387  hypothetical protein  44.17 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  39.73 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  33.98 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  37.5 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  35.59 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  38.78 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  32.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  36.97 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  40.26 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  43.42 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  41.11 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  34.38 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  42.67 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  36.89 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  41.43 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  35.59 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  31.4 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  39.56 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  38.26 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  36.97 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4506  hypothetical protein  43.06 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  31.36 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  41.77 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  31.3 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  44.74 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  32.54 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  40.74 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  27.48 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  38.61 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  41.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  31.43 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  37.33 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  31.9 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  40.26 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  44.16 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  31.96 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  31.97 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  29.66 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  28.8 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  30.89 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  36.54 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  33.02 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  31.53 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.242011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  32.18 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  32.17 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  30.58 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  33.64 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  28.3 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  29.17 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  26.32 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  37.04 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  31.96 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  27.12 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  31.3 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  27 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  32.71 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  32.63 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1723  hypothetical protein  33.73 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.822691  normal  0.436905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  28.28 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32820  hypothetical protein  32.98 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  28.28 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  28.28 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>