145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2725 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  100 
 
 
129 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  63.2 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  56.2 
 
 
137 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  52.89 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  56.67 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  55.12 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  53.28 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  55 
 
 
121 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  54.17 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  55 
 
 
121 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  46.77 
 
 
139 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  53.85 
 
 
135 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  52.99 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  47.86 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  44.63 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  97.1  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  41.67 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  48.21 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  38.33 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  45.45 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  45.53 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  40.5 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32820  hypothetical protein  53.72 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  47.11 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  40.5 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  41.46 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  36.07 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  39.84 
 
 
158 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  57.89 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  56.58 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  40.5 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  45.68 
 
 
142 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  44.95 
 
 
139 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  41.67 
 
 
125 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  41.53 
 
 
121 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  56.58 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  39.17 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  43.22 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  33.59 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  40.57 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  44.44 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  47.44 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  38.02 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  34.78 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  48.75 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  47.56 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  49.32 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  49.32 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  51.9 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2014  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  52.05 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  40.34 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  38.14 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  34.23 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  41.46 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  38.4 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  41 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  42.31 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  46.75 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  39.13 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  35.29 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  41.05 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  41.05 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  41.05 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  35.29 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  45 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1074  hypothetical protein  46.72 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  35.09 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  43.75 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  42.11 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  45.57 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  41.03 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  34.48 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  36.21 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  35.2 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  36.9 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3237  hypothetical protein  45.08 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0868911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  41.98 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  40.74 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  43.75 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  39 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  42.5 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  44.74 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0848  hypothetical protein  31.97 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.225476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  38.61 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  39.5 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>