118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2137 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  99.14 
 
 
178 aa  224  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  223  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0773  hypothetical protein  85.22 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  57.89 
 
 
142 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  57.02 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  55.75 
 
 
155 aa  115  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  51.75 
 
 
123 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  47.37 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  46.49 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  42.61 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  42.48 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  37.39 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  39.47 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  53.75 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  40.59 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  46.15 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  40.87 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  54.55 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  57.14 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  36.61 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  48.75 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  52.56 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  48.57 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  41.96 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  46.91 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  34.78 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  49.3 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  37.07 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  37.65 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6297  protein of unknown function DUF454  40.52 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  40.71 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  49.28 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3577  hypothetical protein  41.96 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  49.28 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  38.67 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  42.31 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  46.58 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  44.3 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  46.58 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4220  hypothetical protein  42.31 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1003  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  46.58 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  43.18 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  40.74 
 
 
165 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  41.44 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  41.03 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  36.21 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2014  hypothetical protein  41.77 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  42.86 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  42.05 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  38.55 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  45.59 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  37.65 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  47.06 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  45.21 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  45.21 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4506  hypothetical protein  45.71 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1774  protein of unknown function DUF454  35.96 
 
 
156 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486547  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  36.75 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4381  hypothetical protein  39.74 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  45.21 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  52.38 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  38.64 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  38.37 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  38.82 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  48 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  37.65 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  52.54 
 
 
202 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  33.04 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  39.51 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  39.02 
 
 
139 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  42.86 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  39.44 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  44.87 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  33.33 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  36.47 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0722  hypothetical protein  30.91 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1021  hypothetical protein  37.93 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706161  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  37.65 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>