135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4200 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4200  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  271  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00544524  normal  0.158508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0042  hypothetical protein  78.83 
 
 
139 aa  191  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.701036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  43.09 
 
 
137 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  36.97 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  36.3 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  39.45 
 
 
135 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  38.71 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  40.17 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  39.32 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  38.05 
 
 
135 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  46.51 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0152  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0157  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  46.43 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  50.62 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  36.64 
 
 
202 aa  73.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2306  protein of unknown function DUF454  36.11 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000646681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1045  hypothetical protein  35.48 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000150316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  43.75 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  42.27 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  41 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  42.31 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  46.84 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0981  protein of unknown function DUF454  33.88 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  42.57 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1723  hypothetical protein  44.79 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.822691  normal  0.436905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  46.58 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  37.27 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  39.81 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  45.21 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  31.19 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  40.22 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  45 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  42.53 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32820  hypothetical protein  41.8 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  42.55 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0795  hypothetical protein  30.36 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  42.06 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  34.13 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  37.27 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  39 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  29.82 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  31.9 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1558  protein of unknown function DUF454  41.76 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000017968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  40.7 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  39.8 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  36.14 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  33.71 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2014  hypothetical protein  36.54 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  42.62 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  40.7 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  36.49 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2502  hypothetical protein  41.56 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  41.54 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  38.78 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  40.96 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  40.96 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6297  protein of unknown function DUF454  44.62 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  28.57 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  37.8 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  39.67 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  38.74 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  39.19 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2052  hypothetical protein  42.11 
 
 
178 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0987297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  42.5 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3103  hypothetical protein  36.52 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362417  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0218  hypothetical protein  34.04 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0217  hypothetical protein  34.04 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  35.87 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  38.46 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1578  protein of unknown function DUF454  43.42 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  44.44 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2296  hypothetical protein  43.24 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656544  normal  0.0252392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  45.76 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1115  hypothetical protein  39.34 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.242011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  35.8 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  41.38 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2137  hypothetical protein  43.59 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.887096  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  38.1 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  38.1 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  35.56 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  51.06 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>