39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0882 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0882  response regulator receiver protein  100 
 
 		 348 aa  687    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.280434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2577  hypothetical protein  61.32 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.378417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  26.75 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  24.12 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  25.55 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  24.78 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  23.91 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5251  hypothetical protein  27.61 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 2022 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  24.2 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  25.11 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 2026 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  34.19 
 
 		 2026 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  35.34 
 
 		 1983 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  35.96 
 
 		 2092 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 2164 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 2137 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  24.66 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 1970 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  26.52 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.91 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.91 
 
 		 311 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  32.48 
 
 		 1888 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  25.97 
 
 		 561 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 233 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 233 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 2414 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>