68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2537 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2537  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1690  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  67.1 
 
 		 155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.483378  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1836  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  64.74 
 
 		 165 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.228853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0793  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  60.53 
 
 		 155 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.424417  hitchhiker  0.000000623448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0619  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  61.38 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1257  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.68 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2302  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  54.11 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.162343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0521  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  49.35 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.646592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1284  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.03 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0066  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.9 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1663  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  50.34 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1158  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.7 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0373635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3466  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  49.66 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1167  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.68 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1677  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  47.37 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1963  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.26 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1120  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  45.32 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00691947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  45.58 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.52 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0356  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  45.58 
 
 		 148 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00169801 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1694  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.52 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.341043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0358  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  42.76 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.113666 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1776  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.1 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000334817 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1588  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.1 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0429  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  43.54 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1563  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  44.22 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0566  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  41.18 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0147678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1687  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.86 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.441671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2667  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  43.97 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002418  aspartate carbamoyltransferase regulatory chain PyrI  35.37 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03648  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.01 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2093  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.23 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3736  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.13 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3295  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0419  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3750  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5766  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4839  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4725  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04076  hypothetical protein  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3767  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0366  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04112  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4817  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4500  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848826  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4862  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0518  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.73 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4743  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4806  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4841  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4712  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.24 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110396  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3571  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.68 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1159  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0042  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  43.45 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0499  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0435  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0446  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  35.33 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0544  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.23 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0259  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.23 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0781  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  33.58 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0533  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.813179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2751  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1193  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.21 
 
 		 522 aa  67.4  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0977  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.68 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0223  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.21 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1306  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.82 
 
 		 527 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1149  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.82 
 
 		 527 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0129  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  26.92 
 
 		 535 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00714035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>