68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1158 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1158  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0373635  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_1677  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  55.63 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
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NC_009440  Msed_1963  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  56.41 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.811384 
 
 
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NC_009073  Pcal_1776  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  59.57 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000334817 
 
 
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NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  59.57 
 
 		 171 aa  167  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
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NC_010525  Tneu_1588  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  58.87 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008553  Mthe_1257  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  56.46 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009376  Pars_1694  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  58.16 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.341043  normal  1 
 
 
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NC_013926  Aboo_1120  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  50.65 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00691947  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_1284  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  55.33 
 
 		 152 aa  157  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_2537  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.7 
 
 		 155 aa  153  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3466  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  53.33 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013158  Huta_0521  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  52.29 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.646592  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_2302  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  53.29 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.162343  normal  1 
 
 
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NC_013743  Htur_1663  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  56.2 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1836  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50.68 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.228853  normal  1 
 
 
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NC_009954  Cmaq_0566  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50.33 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0147678 
 
 
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NC_009051  Memar_1690  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.3 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.483378  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0793  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.74 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.424417  hitchhiker  0.000000623448 
 
 
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NC_007355  Mbar_A1167  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  48.97 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007796  Mhun_0619  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  52.17 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
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NC_007955  Mbur_0066  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  52.11 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010085  Nmar_1687  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  45.58 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.441671 
 
 
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NC_008709  Ping_3295  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.54 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  44.52 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0429  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  41.78 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0358  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  42.07 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.113666 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0356  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  43.84 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00169801 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1563  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  44.52 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2667  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  45.64 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0042  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.33 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A4500  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848826  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_3750  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04076  hypothetical protein  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5766  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4839  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4725  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_3767  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4817  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_04112  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  40.14 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0518  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.6 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3571  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.16 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3736  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.84 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03648  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.04 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0446  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.78 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012837 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4806  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4862  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4712  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110396  normal  0.30816 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4743  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A4841  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.46 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0366  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002418  aspartate carbamoyltransferase regulatory chain PyrI  38.36 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0544  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.56 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_0419  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.75 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2093  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0499  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1159  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0435  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.49 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0259  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.03 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_2751  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  35.17 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0781  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.26 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0533  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.85 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.813179  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1149  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.38 
 
 		 527 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1306  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.38 
 
 		 527 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1193  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.38 
 
 		 522 aa  71.2  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0223  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.38 
 
 		 524 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0977  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  29.75 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002967  TDE0129  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  29.45 
 
 		 535 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00714035  n/a   
 
 
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