67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0366 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0366  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 154 aa  319  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0419  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  98.05 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3571  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  92.72 
 
 		 154 aa  291  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3736  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  92.72 
 
 		 154 aa  289  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0544  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  86.84 
 
 		 154 aa  276  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4806  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  78.43 
 
 		 153 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4862  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  78.43 
 
 		 153 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4743  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  78.43 
 
 		 153 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4712  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  77.78 
 
 		 153 aa  248  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110396  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4841  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  77.78 
 
 		 153 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0446  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  77.12 
 
 		 153 aa  247  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4500  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5766  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3750  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4817  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4839  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4725  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3767  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_04112  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_04076  hypothetical protein  75.16 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0499  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  76.32 
 
 		 155 aa  240  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0435  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  76.32 
 
 		 154 aa  240  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1159  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  75.66 
 
 		 155 aa  238  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007984  BCI_0259  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  72.67 
 
 		 156 aa  223  6e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2093  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  61.84 
 
 		 155 aa  206  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002418  aspartate carbamoyltransferase regulatory chain PyrI  62.5 
 
 		 153 aa  205  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03648  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  60.53 
 
 		 153 aa  203  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0518  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  60.67 
 
 		 154 aa  200  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3295  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  55.63 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
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NC_002950  PG0358  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  42.86 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.113666 
 
 
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NC_013202  Hmuk_2302  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.89 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.162343  normal  1 
 
 
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NC_010085  Nmar_1687  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  41.84 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.441671 
 
 
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NC_012029  Hlac_1284  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.57 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3466  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  37.59 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008698  Tpen_1158  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0373635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0521  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.5 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.646592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1663  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  37.23 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0356  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.57 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00169801 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.85 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_1120  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  39.6 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00691947  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1563  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.85 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0429  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.69 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_2667  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  37.68 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010525  Tneu_1588  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.04 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.6 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
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NC_009051  Memar_1690  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  42.75 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.483378  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_2537  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.41 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007955  Mbur_0066  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.86 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A1167  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  41.38 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008553  Mthe_1257  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.26 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009376  Pars_1694  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.04 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.341043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0566  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.73 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0147678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1677  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  36.69 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1963  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  35.57 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0793  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.14 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.424417  hitchhiker  0.000000623448 
 
 
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NC_009073  Pcal_1776  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.3 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000334817 
 
 
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NC_009712  Mboo_1836  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.41 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.228853  normal  1 
 
 
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NC_009635  Maeo_0042  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.41 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0533  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.27 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.813179  n/a   
 
 
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NC_013171  Apre_0781  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  35.56 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0619  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.06 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
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NC_010001  Cphy_2751  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.86 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1193  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.79 
 
 		 522 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_1149  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.92 
 
 		 527 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0223  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.43 
 
 		 524 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1306  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  30.92 
 
 		 527 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0977  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.13 
 
 		 525 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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