68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1776 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1776  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 151 aa  302  8.000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000334817 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1694  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  87.42 
 
 		 151 aa  276  5e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.341043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0505  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  84.77 
 
 		 171 aa  270  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.219397 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1588  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  83.44 
 
 		 151 aa  265  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0566  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  60.81 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0147678 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1158  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  59.57 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0373635  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1677  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  54.05 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1963  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  55.47 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.811384 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1257  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50.35 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1690  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  56.34 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.483378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1120  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  48.67 
 
 		 154 aa  137  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00691947  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1663  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  50.72 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0521  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  49.29 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.646592  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1284  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3466  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  46.43 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2302  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.162343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0619  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.8 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2537  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.1 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1167  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.1 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  48.61 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1563  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  48.61 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0356  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.92 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00169801 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1687  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.78 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.441671 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0793  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  47.52 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.424417  hitchhiker  0.000000623448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0429  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  45.14 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1836  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  46.38 
 
 		 165 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.228853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0066  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  45.77 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2667  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  41.72 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0042  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  50.69 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0518  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03648  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.36 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0544  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3295  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.27 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002418  aspartate carbamoyltransferase regulatory chain PyrI  37.67 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0358  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.32 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.113666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3571  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0446  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  39.16 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0366  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.3 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0499  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.59 
 
 		 155 aa  94.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2093  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.67 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1159  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.59 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3736  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  36.99 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4712  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110396  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0435  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.59 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0533  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.03 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.813179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4841  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4806  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4862  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4743  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  38.46 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0419  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.93 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3750  aspartate carbamoyltransferase, regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04076  hypothetical protein  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0781  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.47 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4839  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5766  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4725  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3767  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04112  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4817  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4500  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.06 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.848826  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0259  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  37.5 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2751  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.85 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1306  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.46 
 
 		 527 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1149  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  34.46 
 
 		 527 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1193  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  32.65 
 
 		 522 aa  77.4  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0223  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  31.76 
 
 		 524 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0977  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  28.66 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0129  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  25.49 
 
 		 535 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00714035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>