More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0977 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0223  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  72.08 
 
 
524 aa  793    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1193  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  76.92 
 
 
522 aa  837    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0977  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
525 aa  1077    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1306  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  72.81 
 
 
527 aa  810    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1149  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  72.81 
 
 
527 aa  810    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0129  bifunctional aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit/aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  51.5 
 
 
535 aa  544  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00714035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3294  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.94 
 
 
311 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.773416  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1750  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.02 
 
 
302 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.667028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.23 
 
 
302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.189832  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1168  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  29.64 
 
 
308 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1014  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.23 
 
 
302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.13562  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1256  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32 
 
 
304 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04113  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3749  aspartate carbamoyltransferase  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4501  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04077  hypothetical protein  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3766  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4838  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5767  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4726  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.95 
 
 
311 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0420  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.04 
 
 
311 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1121  aspartate carbamoyltransferase  31.83 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00702877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03647  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.13 
 
 
321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4713  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465159  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.83 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4842  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4807  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4744  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4628  aspartate carbamoyltransferase  35.42 
 
 
337 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0959  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.36 
 
 
302 aa  131  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002419  aspartate carbamoyltransferase  33.68 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.55 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.934778  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0367  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.85 
 
 
311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1689  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.13 
 
 
298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.417019  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2385  aspartate carbamoyltransferase  32.51 
 
 
337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000797149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0519  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.33 
 
 
309 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0792  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.73 
 
 
303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.311854  hitchhiker  0.000000216134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0447  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.63 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3735  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.55 
 
 
311 aa  127  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0496  aspartate carbamoyltransferase  32.99 
 
 
334 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2892  aspartate carbamoyltransferase  31.16 
 
 
339 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000646707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2974  aspartate carbamoyltransferase  31.16 
 
 
339 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.771766  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2092  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.93 
 
 
330 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1301  aspartate carbamoyltransferase  31.16 
 
 
339 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3070  aspartate carbamoyltransferase  31.16 
 
 
339 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2913  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.58 
 
 
336 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00485  aspartate carbamoyltransferase  33.68 
 
 
354 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.01 
 
 
304 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.485741  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0840  aspartate carbamoyltransferase  31.95 
 
 
339 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1205  aspartate carbamoyltransferase  30.56 
 
 
339 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3152  aspartate carbamoyltransferase  30.56 
 
 
339 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1160  aspartate carbamoyltransferase  30.56 
 
 
339 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1238  aspartate carbamoyltransferase  30.56 
 
 
339 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324325  normal  0.849044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0500  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.27 
 
 
311 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.879834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0436  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.27 
 
 
311 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1158  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.27 
 
 
311 aa  124  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1120  aspartate carbamoyltransferase  30.56 
 
 
339 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1089  aspartate carbamoyltransferase  31.04 
 
 
339 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0175924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
311 aa  123  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1066  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  33.44 
 
 
304 aa  123  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2603  aspartate carbamoyltransferase  31.67 
 
 
359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0520  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.13 
 
 
305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0028  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.77 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5513  aspartate carbamoyltransferase  31.51 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.36 
 
 
323 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0927  aspartate carbamoyltransferase  28.91 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0065  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.36 
 
 
308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0622  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.66 
 
 
323 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1204  aspartate carbamoyltransferase  31.14 
 
 
431 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1339  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  32.29 
 
 
314 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1285  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.71 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1013  aspartate carbamoyltransferase  32.98 
 
 
339 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2818  aspartate carbamoyltransferase  32.28 
 
 
339 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0185554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0975  aspartate carbamoyltransferase  32.28 
 
 
339 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  28.52 
 
 
320 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0024  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.43 
 
 
304 aa  117  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00458204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3798  aspartate carbamoyltransferase  30.72 
 
 
431 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0346  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.54 
 
 
321 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419246  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4709  aspartate carbamoyltransferase  31.06 
 
 
431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.916091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  29.53 
 
 
323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.31 
 
 
323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.1 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4187  aspartate carbamoyltransferase  31.06 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4730  aspartate carbamoyltransferase  32.14 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  0.148121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0897  aspartate carbamoyltransferase  30.03 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2668  aspartate carbamoyltransferase  31.71 
 
 
311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5476  aspartate carbamoyltransferase  30.38 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3560  aspartate carbamoyltransferase  30.38 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4807  aspartate carbamoyltransferase  30.38 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1387  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.14 
 
 
307 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1201  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  35.14 
 
 
307 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1172  aspartate carbamoyltransferase  30.29 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.00000909543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2979  aspartate carbamoyltransferase  31.93 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  28.86 
 
 
320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  31.1 
 
 
346 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1157  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  28.4 
 
 
315 aa  114  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.39 
 
 
320 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  30.39 
 
 
320 aa  114  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>