27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1538 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1538  protein of unknown function DUF99  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1663  hypothetical protein  56.99 
 
 
197 aa  225  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1803  hypothetical protein  56.22 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0335  hypothetical protein  56.52 
 
 
217 aa  207  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1565  hypothetical protein  53.51 
 
 
194 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.854184  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0247  hypothetical protein  45.9 
 
 
199 aa  167  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0633  hypothetical protein  42.93 
 
 
193 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1183  protein of unknown function DUF99  47.4 
 
 
186 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.903169  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3155  protein of unknown function DUF99  42.44 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1894  hypothetical protein  39.13 
 
 
193 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.446814  normal  0.612706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1444  protein of unknown function DUF99  42.59 
 
 
253 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1767  protein of unknown function DUF99  41.67 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1187  hypothetical protein  36.31 
 
 
212 aa  115  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0119  hypothetical protein  36.63 
 
 
182 aa  108  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0138  hypothetical protein  34.08 
 
 
219 aa  106  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0338187 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0381  protein of unknown function DUF99  37.93 
 
 
195 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.162805  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0148  hypothetical protein  33.89 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.241641  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  28.42 
 
 
190 aa  92  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  29.47 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  23.63 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  23.63 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1654  protein of unknown function DUF99  30.67 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.796048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1005  hypothetical protein  26.8 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.504869  hitchhiker  0.000432809 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  24.86 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  21.98 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2677  protein of unknown function DUF99  25.95 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>