27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1654 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1654  protein of unknown function DUF99  100 
 
 
187 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.796048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2677  protein of unknown function DUF99  39.34 
 
 
188 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  35.11 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  30.98 
 
 
194 aa  91.3  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  26.14 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1005  hypothetical protein  35.16 
 
 
187 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.504869  hitchhiker  0.000432809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2318  hypothetical protein  36.6 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.211375  normal  0.0854768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  28.12 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  24.43 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1803  hypothetical protein  27.93 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1538  protein of unknown function DUF99  30.67 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1444  protein of unknown function DUF99  28.57 
 
 
253 aa  61.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1894  hypothetical protein  26.54 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.446814  normal  0.612706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0633  hypothetical protein  21.76 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0335  hypothetical protein  26.06 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1183  protein of unknown function DUF99  28.29 
 
 
186 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.903169  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3155  protein of unknown function DUF99  29.17 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1663  hypothetical protein  25.45 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0002  hypothetical protein  26.82 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23639 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0247  hypothetical protein  22.47 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0119  hypothetical protein  25.15 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1565  hypothetical protein  26.16 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.854184  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0148  hypothetical protein  27.12 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.241641  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1187  hypothetical protein  25.64 
 
 
212 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1767  protein of unknown function DUF99  27.03 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>