27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2677 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2677  protein of unknown function DUF99  100 
 
 
188 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1005  hypothetical protein  61.33 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.504869  hitchhiker  0.000432809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  51.91 
 
 
187 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  40.86 
 
 
194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2318  hypothetical protein  43.89 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.211375  normal  0.0854768 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  32.16 
 
 
182 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  35.83 
 
 
190 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1654  protein of unknown function DUF99  39.34 
 
 
187 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.796048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  30.81 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  28.07 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  26.32 
 
 
183 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0335  hypothetical protein  29.94 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1894  hypothetical protein  24.59 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.446814  normal  0.612706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1663  hypothetical protein  30.18 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1565  hypothetical protein  28.96 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.854184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1538  protein of unknown function DUF99  25.95 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1803  hypothetical protein  28.11 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0633  hypothetical protein  25.31 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0247  hypothetical protein  24.19 
 
 
199 aa  54.7  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0148  hypothetical protein  29.19 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.241641  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1183  protein of unknown function DUF99  32.72 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.903169  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1767  protein of unknown function DUF99  38.05 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0002  hypothetical protein  26.11 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23639 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0138  hypothetical protein  28.74 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0338187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0119  hypothetical protein  28.29 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1187  hypothetical protein  25.61 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1232  protein of unknown function DUF99  23.4 
 
 
179 aa  42  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>