12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0002 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0002  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.23639 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1232  protein of unknown function DUF99  47.93 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  28.89 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  31.03 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  30.51 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  29.37 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  29.66 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1654  protein of unknown function DUF99  26.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.796048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2677  protein of unknown function DUF99  26.11 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  27.12 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2318  hypothetical protein  26.44 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.211375  normal  0.0854768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>