27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2350 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  374  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2677  protein of unknown function DUF99  51.91 
 
 
188 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.710572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1005  hypothetical protein  50.82 
 
 
187 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.504869  hitchhiker  0.000432809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  43.24 
 
 
194 aa  154  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  35.94 
 
 
190 aa  121  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2318  hypothetical protein  35.03 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.211375  normal  0.0854768 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  31.43 
 
 
183 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  28.74 
 
 
183 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1654  protein of unknown function DUF99  35.11 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.796048  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  27.59 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0335  hypothetical protein  31.33 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1663  hypothetical protein  31.08 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1538  protein of unknown function DUF99  28.57 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0002  hypothetical protein  28.65 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0633  hypothetical protein  25.5 
 
 
193 aa  61.6  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1565  hypothetical protein  26.14 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.854184  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0247  hypothetical protein  25.28 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1767  protein of unknown function DUF99  32.14 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1894  hypothetical protein  26.85 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.446814  normal  0.612706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1444  protein of unknown function DUF99  29.52 
 
 
253 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1183  protein of unknown function DUF99  29.86 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.903169  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1232  protein of unknown function DUF99  24.31 
 
 
179 aa  54.3  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1803  hypothetical protein  26.55 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0119  hypothetical protein  28 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0138  hypothetical protein  27.44 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0338187 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0381  protein of unknown function DUF99  28.19 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.162805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>