24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0381 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0381  protein of unknown function DUF99  100 
 
 
195 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.162805  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1444  protein of unknown function DUF99  52.07 
 
 
253 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3155  protein of unknown function DUF99  52.75 
 
 
195 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1767  protein of unknown function DUF99  53.67 
 
 
185 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1183  protein of unknown function DUF99  50.28 
 
 
186 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.903169  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0335  hypothetical protein  39.18 
 
 
217 aa  117  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1803  hypothetical protein  40.74 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  0.104711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1663  hypothetical protein  40.88 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0247  hypothetical protein  35.9 
 
 
199 aa  104  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1538  protein of unknown function DUF99  37.93 
 
 
189 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0633  hypothetical protein  30.98 
 
 
193 aa  89  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1894  hypothetical protein  31.35 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.446814  normal  0.612706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1565  hypothetical protein  31.75 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.854184  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1187  hypothetical protein  32.97 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0119  hypothetical protein  31.55 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0138  hypothetical protein  31.69 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0338187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1283  protein of unknown function DUF99  26.59 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0148  hypothetical protein  29.28 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.241641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0619  hypothetical protein  26.4 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0162  hypothetical protein  21.84 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0990407  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1063  hypothetical protein  21.86 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1801  hypothetical protein  20.56 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.245914  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0855  hypothetical protein  20.22 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.363705  hitchhiker  0.00471333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2350  hypothetical protein  28.19 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000169499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>