21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1260 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  54.26 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  44.37 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  49.22 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  49.22 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  44.74 
 
 		 168 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  45.86 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  44.27 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  42.03 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  42.97 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  42.97 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  42.97 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  39.08 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  39.08 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  28.47 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  30.41 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  25.87 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  25.18 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  23.74 
 
 		 164 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>