17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1512 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1990  protein of unknown function DUF55  25.33 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.451343  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  29.29 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  25.15 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  33.01 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  27.21 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  26.92 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  26.43 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  27.34 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  27.21 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  28.06 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  28.06 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1971  hypothetical protein  20.75 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.072557  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  26.43 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  30.97 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  28.97 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  28.57 
 
 
149 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>