17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0064 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  333  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  333  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  95 
 
 
140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  87.86 
 
 
140 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  66.9 
 
 
146 aa  197  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  63.64 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  64.79 
 
 
146 aa  190  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  41.84 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  34.62 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0404  protein of unknown function DUF55  27.08 
 
 
174 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0316632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  28.06 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  27.43 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  35.42 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  35.42 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  35.42 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>