16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0611 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  94.48 
 
 
146 aa  280  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  71.72 
 
 
143 aa  207  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  64.79 
 
 
164 aa  190  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  64.79 
 
 
164 aa  190  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  62.86 
 
 
140 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  61.87 
 
 
140 aa  178  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  36.81 
 
 
164 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  34.72 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  30.09 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0404  protein of unknown function DUF55  31.11 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0316632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1512  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.223657  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  22.67 
 
 
373 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>