22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1478 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  337  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  60.96 
 
 
145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  59.18 
 
 
157 aa  192  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  39.16 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  37.67 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  37.86 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  35.71 
 
 
140 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  36.81 
 
 
146 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0404  protein of unknown function DUF55  28.66 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0316632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  25.33 
 
 
373 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  25.15 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1832  protein of unknown function DUF55  27.52 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.73 
 
 
568 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1990  protein of unknown function DUF55  22.01 
 
 
150 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.451343  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  23.74 
 
 
146 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  25.52 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  25.52 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  25.52 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1505  hypothetical protein  23.26 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>