18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1515 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  66.21 
 
 
157 aa  209  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  60.96 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  43.15 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  36.76 
 
 
140 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  37.76 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  35.21 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  35.21 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  34.72 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0404  protein of unknown function DUF55  27.78 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0316632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1832  protein of unknown function DUF55  25.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  25.87 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  24 
 
 
373 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  26.55 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  21.74 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>