25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3079 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  100 
 
 
143 aa  293  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  40.58 
 
 
149 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  42.86 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  44.27 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  40.91 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  40.3 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  36.57 
 
 
168 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  37.78 
 
 
150 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  34.97 
 
 
149 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  39.85 
 
 
142 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  36.09 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  36.09 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  36.09 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  28.77 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  34.12 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  34.12 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  33.01 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  26.72 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  30.09 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  30.09 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  27.43 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  27.43 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  27.68 
 
 
157 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  26.55 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>