21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0055 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  78.68 
 
 		 145 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  77.78 
 
 		 141 aa  224  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  50.37 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  45.19 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  44.36 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  42.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  41.04 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  41.01 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  36.09 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  34.97 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  42.53 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0541  Beta-propeller repeat TECPR  33.8 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  25.52 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  31.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>