17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1825 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 149 aa  306  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  52.48 
 
 		 168 aa  153  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  53.57 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  49.65 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  46.43 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  43.45 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  41.55 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  40.44 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  42.03 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  34.97 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  41.01 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  41.01 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  41.01 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  43.14 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  43.14 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  27.74 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>