16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1668 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1668  protein of unknown function DUF55  100 
 
 		 113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.902654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0530  hypothetical protein  55.17 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5979  hypothetical protein  46.72 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0106  hypothetical protein  42.64 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1825  protein of unknown function DUF55  43.14 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0785  hypothetical protein  44.79 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0064  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4221  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  39.08 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0055  hypothetical protein  42.53 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0368538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0064  hypothetical protein  42.53 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.707709  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0045  hypothetical protein  42.53 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.0170857 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1640  protein of unknown function DUF55  40.96 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  34.12 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0346  protein of unknown function DUF55  29.41 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>