16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2790 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2790  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  326  9e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.472357  normal  0.170654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1515  hypothetical protein  66.21 
 
 
145 aa  209  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.317091  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1478  hypothetical protein  59.18 
 
 
164 aa  192  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.939784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2050  hypothetical protein  45.89 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.610136  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0015  hypothetical protein  38.36 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00905926  hitchhiker  0.000816539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0611  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.163555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0078  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0266  hypothetical protein  38.35 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0366322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0064  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1838  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.978464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0637  hypothetical protein  35.29 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1512  hypothetical protein  26.92 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1260  protein of unknown function DUF55  30.41 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  26 
 
 
373 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1990  protein of unknown function DUF55  25.55 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.451343  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3079  protein of unknown function DUF55  27.68 
 
 
143 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>