34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0336 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  76 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  75.81 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  69.35 
 
 		 125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  68 
 
 		 125 aa  176  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  62.1 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  50.81 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  54.4 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  51.2 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  48.39 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  50.4 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  47.58 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  45.97 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  50.4 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  50.4 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  47.2 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  46.4 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  47.2 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  46.4 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.14774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  46.4 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  51.2 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  40.48 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  39.2 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  39.32 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  34.92 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  42.11 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  38.95 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  37.63 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.63 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  41.84 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70383  Killer toxin Resistant  35.29 
 
 		 261 aa  42.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.650262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>