30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1565 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 		 131 aa  254  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  85.5 
 
 		 131 aa  228  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  83.21 
 
 		 131 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  85.5 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  51.94 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.14774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  49.21 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  48.03 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  48.8 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  45.74 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  45.24 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  42.4 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  41.27 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  40 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  38.89 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  38.89 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  40 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  39.52 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  39.68 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  43.55 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  40.16 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  42.86 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  43.55 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  41.94 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  39.52 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  38.71 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  44.44 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  38.37 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.84 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  31.63 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>