27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03720 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  61.5 
 
 
201 aa  252  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  59.11 
 
 
202 aa  246  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  56.78 
 
 
220 aa  239  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  56.65 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  38.54 
 
 
127 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  34.38 
 
 
125 aa  58.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  37.63 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  37 
 
 
125 aa  55.5  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  35.35 
 
 
125 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  35 
 
 
126 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  35.48 
 
 
125 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  32.04 
 
 
128 aa  52.4  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  32.26 
 
 
125 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  31.13 
 
 
128 aa  49.7  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  34.38 
 
 
125 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  29.59 
 
 
133 aa  48.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  32.29 
 
 
124 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  27.84 
 
 
128 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  34.02 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  27.84 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  27.84 
 
 
128 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  26.21 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  27.84 
 
 
128 aa  42  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  29 
 
 
123 aa  42  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  30.93 
 
 
123 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  28.28 
 
 
131 aa  41.6  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>