28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71938 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  71.57 
 
 
201 aa  294  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  59.11 
 
 
208 aa  246  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  58.94 
 
 
205 aa  230  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.08 
 
 
220 aa  229  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  40 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  42.39 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  42.11 
 
 
125 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  37 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  38.95 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  39.39 
 
 
125 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  39.8 
 
 
125 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  35.71 
 
 
126 aa  61.6  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  38.78 
 
 
125 aa  61.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  36.46 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  36.54 
 
 
128 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  34.74 
 
 
124 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  36.46 
 
 
123 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  34.34 
 
 
123 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  33.02 
 
 
128 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  34.69 
 
 
128 aa  48.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  33.67 
 
 
128 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  33.33 
 
 
123 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  30.93 
 
 
133 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  32.65 
 
 
128 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  32.65 
 
 
128 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  33.33 
 
 
131 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  28.71 
 
 
131 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>