33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1338 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  100 
 
 
128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0958  30S ribosomal protein S8e  65.62 
 
 
128 aa  175  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1751  30S ribosomal protein S8e  65.62 
 
 
128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.606642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0930  30S ribosomal protein S8e  64.84 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.626224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1015  30S ribosomal protein S8e  64.84 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.106071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  53.97 
 
 
126 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  53.66 
 
 
127 aa  134  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  53.23 
 
 
125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  50.81 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  56.91 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  56.91 
 
 
125 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  52.03 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  49.59 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  48.39 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  48.44 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  49.59 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  47.58 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  48.78 
 
 
123 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  49.61 
 
 
133 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  47.54 
 
 
123 aa  100  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1732  30S ribosomal protein S8e  45.6 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.597289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  42.19 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0575  30S ribosomal protein S8e  40.48 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00513851 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1565  30S ribosomal protein S8e  42.4 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  42.52 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1745  30S ribosomal protein S8e  43.55 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.179998  hitchhiker  0.00118469 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  43.9 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0520  30S ribosomal protein S8e  41.32 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.11 
 
 
220 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  36.54 
 
 
202 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  31.13 
 
 
208 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  36.54 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  31.73 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>