24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00465 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00465  40S ribosomal protein S8e (AFU_orthologue; AFUA_1G04320)  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.766065  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71938  predicted protein  71.57 
 
 
202 aa  294  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03720  40S ribosomal protein S8, putative  61.5 
 
 
208 aa  252  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29541  Ribosomal protein S8, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  57.5 
 
 
220 aa  226  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00746212 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17414  predicted protein  57.97 
 
 
205 aa  214  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1516  30S ribosomal protein S8e  43.48 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.70504  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1293  30S ribosomal protein S8e  35.79 
 
 
127 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000273371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2307  30S ribosomal protein S8e  38.95 
 
 
125 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145351  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0336  30S ribosomal protein S8e  38.95 
 
 
125 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.691451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0469  30S ribosomal protein S8e  37.76 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.968411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2485  30S ribosomal protein S8e  37.76 
 
 
125 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2101  30S ribosomal protein S8e  36.89 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3465  30S ribosomal protein S8e  36.17 
 
 
125 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0040135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1412  ribosomal protein S8e  32.65 
 
 
126 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1967  30S ribosomal protein S8e  31.31 
 
 
123 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.111484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0498  ribosomal protein S8e  32.63 
 
 
124 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2474  ribosomal protein S8e  33.33 
 
 
123 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0172  30S ribosomal protein S8e  31.07 
 
 
128 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0667918  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1338  30S ribosomal protein S8e  31.73 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0917  30S ribosomal protein S8e  30.67 
 
 
123 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0358  30S ribosomal protein S8e  27.88 
 
 
128 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.793187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1141  ribosomal protein S8e  27.55 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1630  30S ribosomal protein S8e  29.47 
 
 
131 aa  42.4  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.14774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1797  ribosomal protein S8e  29.17 
 
 
123 aa  42.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.185164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>