20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5081 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  98.45 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  95.35 
 
 		 129 aa  244  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  96.12 
 
 		 129 aa  224  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5787  VRR-NUC domain protein  59.12 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  58.59 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  32.32 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  40.7 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  36.67 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  36 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  34.44 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3890  hypothetical protein  39.78 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395655  decreased coverage  0.000269668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  39.08 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02760  VRR-NUC domain-containing protein  31.96 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.60673e-17 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1331  VRR-NUC  35.16 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.763526  normal  0.0424341 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  32.14 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1192  VRR-NUC domain protein  32.67 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.476317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>