16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4094 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  96.83 
 
 		 126 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  94.4 
 
 		 127 aa  229  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  58.91 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  63.37 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  63.37 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5787  VRR-NUC domain protein  44.63 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  37.39 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  37.39 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  35.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  32.35 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  33.64 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  32 
 
 		 169 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>