20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2627 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 129 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  94.57 
 
 		 129 aa  224  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  96.08 
 
 		 129 aa  199  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  95.1 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  58.59 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5787  VRR-NUC domain protein  56.93 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  38.89 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  39.8 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  37.78 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  37.78 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02760  VRR-NUC domain-containing protein  34.02 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.60673e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3890  hypothetical protein  38.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395655  decreased coverage  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1331  VRR-NUC  35.29 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.763526  normal  0.0424341 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  34.52 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  36.56 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1192  VRR-NUC domain protein  31.68 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.476317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>