15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4465 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  51.63 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  36 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3890  hypothetical protein  35.2 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395655  decreased coverage  0.000269668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  34.82 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02760  VRR-NUC domain-containing protein  31.82 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.60673e-17 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1331  VRR-NUC  25.56 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.763526  normal  0.0424341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  31.31 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  31.93 
 
 		 127 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  31.09 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  31.17 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  31.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  32 
 
 		 126 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>