17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4245 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  96.83 
 
 		 126 aa  236  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  96 
 
 		 127 aa  234  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  59.69 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  58.91 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  62.38 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  62.38 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5787  VRR-NUC domain protein  44.63 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  38.26 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  38.26 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  35.65 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  31.48 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  33.08 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  33.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  31.9 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  31.09 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3890  hypothetical protein  32.48 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395655  decreased coverage  0.000269668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>