16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1980 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1980  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4245  VRR-NUC domain protein  96 
 
 		 126 aa  234  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4094  VRR-NUC domain protein  94.4 
 
 		 126 aa  229  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  58.59 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  57.81 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  61 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  61 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5787  VRR-NUC domain protein  41.67 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  37.93 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  37.93 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  36.21 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  30.68 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  31.93 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  31.45 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>