15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02760 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02760  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  235  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.60673e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4127  VRR-NUC domain-containing protein  42.98 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3890  hypothetical protein  41.03 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395655  decreased coverage  0.000269668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1554  hypothetical protein  39.29 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272176  decreased coverage  0.0000324297 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1331  VRR-NUC  38.38 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.763526  normal  0.0424341 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4970  hypothetical protein  40.54 
 
 		 177 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.0379158 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4465  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0893  VRR-NUC domain protein  31.68 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2627  VRR-NUC domain protein  34.02 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2313  VRR-NUC domain protein  33.04 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2158  hypothetical protein  33.04 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3793  VRR-NUC domain protein  31.48 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3837  VRR-NUC domain protein  32.95 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2492  VRR-NUC domain protein  34.09 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.681289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5081  VRR-NUC domain protein  34.09 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>