25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3444 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  100 
 
 
671 aa  1313    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  100 
 
 
663 aa  1297    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  62.58 
 
 
662 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  99.25 
 
 
663 aa  1286    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  60.06 
 
 
660 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  63.62 
 
 
661 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  36.88 
 
 
691 aa  300  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  38.95 
 
 
694 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  35.39 
 
 
695 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  35.79 
 
 
699 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  38.55 
 
 
681 aa  230  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  34.25 
 
 
689 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  35.79 
 
 
691 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  30.52 
 
 
681 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.41 
 
 
683 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  31.11 
 
 
716 aa  198  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  30.06 
 
 
710 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  29 
 
 
472 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  46.55 
 
 
203 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  29.64 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  30.43 
 
 
295 aa  48.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6471  hypothetical protein  33.33 
 
 
463 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  32.14 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  23.78 
 
 
277 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  28.03 
 
 
288 aa  43.9  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>