20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07010 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  100 
 
 
716 aa  1377    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  38.55 
 
 
694 aa  303  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  41.44 
 
 
689 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  36.82 
 
 
699 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  31.57 
 
 
695 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  31.98 
 
 
710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.97 
 
 
683 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  33.27 
 
 
691 aa  187  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  29.88 
 
 
681 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  30.89 
 
 
660 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  30.67 
 
 
662 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  31.24 
 
 
663 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  31.29 
 
 
671 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  31.29 
 
 
663 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  31.66 
 
 
661 aa  164  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  33.17 
 
 
681 aa  156  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  31.69 
 
 
691 aa  114  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  30.16 
 
 
472 aa  90.9  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  30.98 
 
 
512 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  36.8 
 
 
203 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>