21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2720 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  88.08 
 
 
662 aa  959    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  100 
 
 
661 aa  1284    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  62.96 
 
 
663 aa  598  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  63.67 
 
 
671 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  63.67 
 
 
663 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  56.64 
 
 
660 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  38.68 
 
 
691 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  36.51 
 
 
695 aa  252  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  36.84 
 
 
694 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  38.87 
 
 
681 aa  230  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  36.55 
 
 
699 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  37.96 
 
 
691 aa  220  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  31.89 
 
 
681 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.74 
 
 
683 aa  207  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  33.33 
 
 
689 aa  197  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  30.2 
 
 
710 aa  185  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  31.93 
 
 
716 aa  184  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  30.74 
 
 
472 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  43.86 
 
 
203 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6471  hypothetical protein  29.76 
 
 
463 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  27.85 
 
 
512 aa  47.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>