21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3816 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1288    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  88.24 
 
 
661 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  62.8 
 
 
663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  62.66 
 
 
671 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  63.17 
 
 
663 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  55.19 
 
 
660 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  38.68 
 
 
691 aa  294  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  36.07 
 
 
695 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  36.44 
 
 
694 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  37.62 
 
 
681 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  36.04 
 
 
699 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  33.16 
 
 
681 aa  220  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  37.82 
 
 
691 aa  220  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.4 
 
 
683 aa  215  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  33.23 
 
 
689 aa  205  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  30.26 
 
 
710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  32.15 
 
 
716 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  32.49 
 
 
472 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  41.79 
 
 
203 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  27.37 
 
 
512 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  25.56 
 
 
257 aa  43.9  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>