21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5245 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
695 aa  1349    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  35.84 
 
 
660 aa  257  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  35.57 
 
 
662 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.93 
 
 
683 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  36.39 
 
 
691 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  35.35 
 
 
661 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  35.08 
 
 
663 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  34.5 
 
 
694 aa  234  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  34.52 
 
 
671 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  34.52 
 
 
663 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  33.11 
 
 
681 aa  219  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  31.61 
 
 
716 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  40.72 
 
 
681 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  37.78 
 
 
699 aa  201  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  30.32 
 
 
710 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  33.75 
 
 
689 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  36.95 
 
 
691 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  46.88 
 
 
203 aa  94.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  28.57 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  27.23 
 
 
512 aa  58.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0004  hypothetical protein  26.61 
 
 
221 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0111409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>