21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0843 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  100 
 
 
699 aa  1337    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  51.34 
 
 
694 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  45.34 
 
 
689 aa  369  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  36.52 
 
 
716 aa  269  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.22 
 
 
683 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  41.22 
 
 
681 aa  253  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  35.98 
 
 
662 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  39.93 
 
 
691 aa  248  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  35.55 
 
 
661 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  36.32 
 
 
663 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  37.95 
 
 
695 aa  239  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  34.71 
 
 
681 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  35.84 
 
 
671 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  35.84 
 
 
663 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  34.32 
 
 
710 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  31.66 
 
 
660 aa  223  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  37.47 
 
 
691 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  32.23 
 
 
472 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  34.02 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  42.34 
 
 
203 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>