22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2744 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  100 
 
 
681 aa  1349    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  78.23 
 
 
683 aa  814    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  42 
 
 
710 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  34.24 
 
 
694 aa  250  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  35.74 
 
 
689 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  33.11 
 
 
695 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  34.66 
 
 
691 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  31.73 
 
 
661 aa  225  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  35.05 
 
 
662 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  30.21 
 
 
660 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  30.61 
 
 
663 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  30.44 
 
 
671 aa  200  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  30.44 
 
 
663 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  38.24 
 
 
699 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  30.27 
 
 
716 aa  196  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  31.54 
 
 
681 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  34.03 
 
 
691 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  32.25 
 
 
472 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  30.45 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  35.82 
 
 
203 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2584  chromosome segregation ATPase-like protein  28.75 
 
 
928 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf057  massive surface protein MspA  20.1 
 
 
2336 aa  45.8  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>