22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4793 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  100 
 
 		 691 aa  1357    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  39.44 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  36.01 
 
 		 660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  37.7 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  38.15 
 
 		 663 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  38.15 
 
 		 671 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  38.63 
 
 		 661 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  35.83 
 
 		 695 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  34 
 
 		 694 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  36.13 
 
 		 681 aa  208  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14950  protein of unknown function (DUF477)  30.31 
 
 		 710 aa  200  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0578757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  33.18 
 
 		 689 aa  200  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  32.14 
 
 		 681 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  36.81 
 
 		 691 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  30.85 
 
 		 716 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30 
 
 		 683 aa  173  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  36.2 
 
 		 699 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1427  hypothetical protein  26.68 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  43.8 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0723  hypothetical protein  27.44 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000029152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  29.85 
 
 		 396 aa  44.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  29.77 
 
 		 251 aa  44.3  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>