18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2817 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.518823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0486  protein of unknown function DUF477  44.35 
 
 		 691 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1453  protein of unknown function DUF477  45.86 
 
 		 681 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5245  protein of unknown function DUF477  45.45 
 
 		 695 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12369  transmembrane protein  47.69 
 
 		 660 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3455  hypothetical protein  42.74 
 
 		 663 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448044  normal  0.304109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31440  methanol dehydrogenase  39.37 
 
 		 694 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0348274  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3507  hypothetical protein  45.19 
 
 		 663 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3444  hypothetical protein  45.19 
 
 		 671 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2933  hypothetical protein  40 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3816  hypothetical protein  41.8 
 
 		 662 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510191  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2720  hypothetical protein  42.37 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0661419  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4793  protein of unknown function DUF477  38.19 
 
 		 691 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07010  protein of unknown function (DUF477)  35.71 
 
 		 716 aa  68.9  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2467  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.86 
 
 		 683 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000265482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0843  protein of unknown function DUF477  38.94 
 
 		 699 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2744  hypothetical protein  38.74 
 
 		 681 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0004  hypothetical protein  28.81 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0111409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>